Исчерпывающие описание проблемы. Что в вашем случае означают "лаги"? Долгое открытие GUI, сильные просадки FPS или полный фриз клиента?
Клиент может подвивать при открытии GUI, расширяемым Not Enough Items - в сборке огромное количество блоков, а формирование списка по фильтрам - слабая сторона этого мода. Его можно отключить, открыв инвентарь ("E") > Опции > NEI: Включен | Выключен.
Но в таком случае вы лишитесь возможности смотреть рецепты горячей клавишей "R", а на рецептах печи и вовсе клиент будет падать с ошибкой.